Toto Kalifornské studio bylo založeno v roce 1996 jako divize vývojáře a vydavatele počítačových her Interplay Productions. "Black Isle (Černý ostrov)" je skotským ostrovem, ze kterého pochází zakladatel studia Feargus Urquhart. Formálně studio navázalo na vývojářskou činnost skupiny lidí v Interplay, která tvořila RPG.
Studio se zapsalo do dějin herní historie vytvořením hry Fallout a spoluprací na hře Baldur's Gate se studiem Bioware. V roce 1998 opustilo studio několik klíčových lidí zodpovědných za Fallout a přidalo se ke studiu Troika Games. Důvodem bylo nedohodnutí se s Interplay na struktuře, jakou by měl mít jejich příští pracovní tým. Následovalo vydání hry Fallout 2, práce na Icewind Dale a jejích pokračováních.
8.prosince 2003 bylo studio zavřeno kvůli velkým finančním problémům v Interplay - během práce na hře Fallout 3 (kódové označení Van Buren). Již o dva roky dříve, v roce 2001, byly zrušeny tituly Stonekeep II, Black Isle's Torn a Baldur's Gate 3: The Black Hound. Mnoho zaměstnanců odešlo po rozpadu Black Isle Studios k Obsidian Entertainment.