Loki'nin 2. sezonu, şaşırtıcı sezon finalinin ardından başlar, Loki kendisini Zaman Farklılık Otoritesi'nin ruhu için verilen bir mücadelede bulur. Mobius M. Mobius, Hunter B-15 ve yeni ve geri dönen karakterlerin bir ekibiyle birlikte, Loki Sylvie, Yargıç Renslayer, Bayan Dakikalar ve özgür iradeye ve muhteşem bir amaca sahip olmanın ne anlama geldiği gerçeğini aramak için giderek genişleyen ve tehlikeli hale gelen çok evrenli bir serüvende ilerler.